El proyecto mantiene la entrada actual a través de la galería pública y el patio norte, que está amueblado para los servicios de recepción, cafetería y tienda, actualmente confinado al vestíbulo central. Para incluir el patio norte en el espacio utilizable, se techará con una burbuja de membrana de ETFE de baja emisividad inflada y translúcida. Esta marquesina autoportante se ancla al perímetro del patio en la cornisa superior del edificio mediante una estructura perimetral de acero. El patio sur, por su parte, seguirá siendo un espacio al aire libre, libre de usos restrictivos. Su piso está formado por guijarros de 2" de diámetro incrustados en arena, como el material encontrado en recientes excavaciones arqueológicas en el sitio. El vestíbulo de entrada entre los patios se libera para albergar las circulaciones verticales que conducen a cada uno de los cuatro niveles del museo. La sala de exposiciones más grande, de 38x11x7 metros, y los cuartos de almacenamiento debajo de ella se encuentran bajo tierra, recorriendo a lo largo del edificio en un itinerario único llamado 'Chile antes de Chile'. Su gran tamaño, o más bien su indefinición, dará al museo salas de exposición una nueva escala. Aquí prevalecerá una penumbra natural, matizada por la luz que entra por dos lucernarios en cada extremo. Se construirá en hormigón teñido de gris antracita y madera de IPE oscura, cuyos bordes se difuminarán a causa de las sombras. , acentuando su condición de excavado o subterráneo. La atención de los visitantes se centrará naturalmente en los elementos expuestos iluminados.